En Midori Edo és un nen en trànsit cap a l'edat adulta. Viu amb l'Aiko, la seva mare soltera, i la seva àvia Masako, i rep visites del seu pare biològic. En Hanada, el seu amic de l'escola, vol vestir-se de dona per anar pel carrer «com si m'estiguessin apunyalant». I la Mizue, que està enamorada d'ell, li demana més proximitat física. Crònica subtil del canvi, la recerca de la identitat sexual i l'amistat, Allò que brilla com el mar és, per damunt de tot, una història en què flueixen amb naturalitat els aspectes més recòndits de l'ànima.